當易碎生物或物料的交叉污染會危及產品降雨或人身安全時，還應采取安全可靠的技術措施防止交叉污染，如嚴格控制不同選定GMP車間凈化之間的靜壓差，合理劃分凈化空調系統，按要求合理設計回風系統等。GMP車間凈化的設計是各種專業設計技術的綜合，尤其是GMP車間凈化的工藝設計、潔凈建筑設計、空氣凈化設計以及各種有特殊要求的設計技術的綜合設計，緊密配合，相互滲透，合理安排。GMP車間凈化工程設計應符合工藝(或使用)流程。

密封條設置在門經常開關的情況下，除了有些外門全部設置在門扇上，以避免重型設備和其他運輸的碰撞，或者有些內門由于車間運輸不允許在地面設置門檻，只能在靠近地面的門扇底部安裝懸掛式清掃密封條。一般為了盡可能避免密封條接觸、踩腳或被車撞，少受人和運輸的影響，在上面鋪設長寬只有幾毫米的小截面形狀的彈性密封條。密封條應沿著活動縫隙的四周連續鋪設，以便在車門關閉后形成一條封閉的環形密封線。門樓和門扇分別設置密封條時，要注意兩者之間的良好連接，盡量減少密封條在門縫處的中斷縫隙。

一般情況下，內門通常只沿門縫設置一圈密封條，一條密封線就夠了。而材料人群的外門和潔凈車間的生產區直接通向外門。為了可靠地防止室外空氣對人的侵害，除了氣閘和雙扇門，而且建筑和風機的截面比一般內門大得多，通常用兩條密封條形成兩道密封線。為了使密封條滿足截面小、受力后壓縮量大的要求，并與受壓構件有足夠的接觸和良好的密封條件，通常制成不同種類的橡膠空心薄壁異型管；而且大部分都是成型品。有多種截面形式，嵌入位置和方式不同。