微生物菌肥被廣泛應用于農業、園藝和土壤修復等領域。它可以替代傳統化學肥料，減少對化學農藥的依賴，同時改善土壤質量和農產品的品質。此外，微生物菌肥也可以用于庭院種植、盆栽花卉等個人或家庭種植環境中，為植物提供養分支持。

生物菌肥的制作通常是將有機廢棄物（如農業殘留物、廚余垃圾等）與特定的菌種進行混合，在適當的環境條件下進行發酵。在發酵過程中，有益微生物代謝活動產生酶和其他代謝產物，分解有機物質并釋放營養物質，如氮、磷、鉀以及有機酸等。這些產物富含植物所需的養分，并且具有改善土壤結構和提高土壤肥力的作用。

微生物菌肥的制作通常涉及將有機廢棄物或有機材料與特定的菌種混合，并在適宜的環境條件下進行發酵。在發酵過程中，微生物通過代謝活動分解廢棄物中的有機物質，釋放出有機酸、酶和其他營養物質。這些產物富含氮、磷、鉀等植物所需的養分，并且具有良好的土壤改良效果。