1、在木包裝箱運輸周轉過程中，由于氣候、機械、生物、化學等因素的影響，會對木包裝箱產生影響，所以，我們需要對木包裝箱做一些防護措施，如防水防潮等，可以在木包裝箱外側再蓋蓬布進行防雨、防日曬。 2、搬運前的準備工作以預防為主、有備無患，為了安全，不受損失，可根據不同情況，按產品規格大小、質量、路程的遠近，選擇合適的搬運方式。 3、裝載貨物不實，貨與貨之間有空隙，在運輸途中造成貨物之間互相碰撞、摩擦，所以裝箱時尤為注意，可以在木包裝箱內外側放置紙屑、瓦楞紙、泡沫等防震材料或用金屬彈簧懸掛，禁止貨物在包裝箱內或箱外竄動。

木包裝箱變色的原因有很多： 1、木材霉變 發霉的木材會導致木制包裝箱表面變色，變綠色、白色、黑色，偶爾也會變成其他顏色；而且木包裝箱發霉變色常呈絮狀或斑點狀。其變色是由霉菌引起的，因為霉菌對環境和基物的適應性和忍耐力比蘭變菌和腐菌要強，霉菌對化學藥物的耐藥性也很強，甚至與某些有毒性的化學藥物接觸時仍能生長，因此，在一些經過防腐處理的木制包裝箱中仍然可以發現霉菌。 2、木材的化學變色 許多樹種的木材都有一定的含水量。但是，當其含水率較高時或較長時間地暴露在潮濕的空氣中會發生變色，木材中的色素、生物堿、糖類、酚類及其它有機物的氧化縮合反應，其中較為主要的是木材中酚類物質的氧化（酚類化合物具有苯環結構，易于被氧化），酚類化合物氧化前為無色，有些可溶于水;氧化后，生成不溶于水的縮合物，顏色為紅色、紅褐色、褐色，因此化學變色又稱為氧化變色。

預防木包裝箱變色的方法： 1、因光變色的預防方法，即隔斷紫外線，隔絕氧氣和捕捉游離基；改變吸光成分結構，破壞參與變色的物質結構，去除變色前驅物。 2、生物變色的預防方法，即改變或破壞適宜微生物或生物生存的溫度、濕度、pH值等環境因子，如噴水保存、塑料密封和化學藥劑處理等等，這些辦法都可以或多或少地改變微生物生存環境，對木包裝箱來說是一種保護。 3、化學變色的預防方法，即用漆膜涂覆等手段阻斷外因，或用溶劑浸泡、化學處理等方法消除或改性木箱內部變色成分。