醫療器械凈化車間的建設是一項系統工程，主要包括建筑裝飾、凈化空調系統、各種動力公用設施和安全設施、各種管道和線路等。其中，建筑裝飾主要包括隔墻、吊頂、地面、常規配套插座、各種配套輔助設備等。凈化車間的隔墻和吊頂主要是凈化板制作成的。
目前凈化板主要分為巖棉凈化板、紙蜂窩凈化板、玻鎂凈化板、自熄性聚苯乙烯凈化板、聚氨酯凈化板等。根據芯材不同。所以價格也不盡相同，凈化板不同材質的選擇對凈化車間的總成本影響很大。
空調機組系統是凈化車間的主要組成部分，凈化車間的使用效果直接關系到空調機組。好的空調機組可以保證凈化車間各個受控機組的參數，如空氣潔凈度、溫濕度、風量、壓差等，而壞的機組可能會使受控機組的參數達不到標準。目前空調機組市場魚龍混雜，選擇知名度較高的品牌很重要。當然，大品牌單位的價格也很漂亮。單位成本是影響凈化車間總成本的重要因素。
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