在設計前，應了解流程類型，并采用合適的入口風速。在PCR實驗室凈化，如果風速太低，有害氣體可能無法完全消除；風速過高會增加能耗，影響柜內工藝操作，如電爐正常加熱，溶劑蒸發加速。通風柜應根據不同種類的測試分成不同的系統。一般每個PCR實驗室凈化系統至多只能有四個通風柜，注意不要把強酸、強氧化劑和易燃易爆系統混在一個PCR實驗室凈化系統中。盡量使用補風通風柜，可以減少70%左右的排煙熱損失。

不同的凈化工程有不同的建設目的和用途，因此凈化工程的不同組成部分是不同的。系統工程技術可分為空氣凈化和水凈化工程。空氣凈化是指在一定的發展空間內，去除空氣中的細顆粒物、有害污染物、細菌等污染物的設計，以及室內工作溫度、潔凈度、壓力、氣流速度與分布、噪聲與振動、照明、靜電等控制范圍內的工程學科。車間實驗室凈化工程，具體建設內容有哪些？自動控制管理系統:包括環境溫度控制、溫度控制、風量和壓力控制、開啟順序和時間成本控制。

實驗室凈化工程不僅起到保護實驗樣品安全的作用，也是保證實驗成功和實驗人員安全的重要措施之一。實驗室凈化工程是將實驗室的某一區域開辟出來，專門用于建造空氣潔凈，對實驗環境要求相對較高的實驗室或無菌室。實驗室凈化工程系統其實和傳統的潔凈室系統差不多，只是潔凈室的壓力、微生物控制、溫濕度控制比工業潔凈室更嚴格。常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾層彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等。潔凈實驗室必須按照潔凈室施工及驗收標準，采用密封性好、不產生粉塵的材料進行隔斷和吊頂裝修。潔凈實驗室的通風系統一般采用組合式空調機組。